发挥生态的自我修复能力是水土保持工作在认真总结过去经验教训的基础上，贯彻中央关于加强生态建设和环境保护，促进经济社会协调发展而采取的重大战略举措。近几年的实践证明，部党组这一决策非常正确，不仅带来了大面积植被的快速恢复，减轻了水土流失，而且促进了区域经济的可持续发展。为推动这项工作的顺利进行，2004年，水利部主要作了以下几项工作：
在原来106个生态修复试点县的基础上，分别在长江流域启动了39个，黄河流域启动了10个生态修复试点县。目前，全国正在实施的生态修复试点县达155个。
● 与中科院联合召开了全国水土保持生态修复研讨会。
● 与农业部联合发出了«关于加强水土保持促进草原保护与建设的通知»。
● 编制了生态修复规划，并加强了基础研究。
据初步统计，目前全国有近千个县实施了封山禁牧，封禁范围达到60多万km2。
生态补水：
2004年严重的春旱使我国大部分地区本已严峻的水资源形势更加严峻，不仅使生产、生活用水十分紧张，也给生态环境带来巨大压力。“华北明珠”白洋淀濒临干 涸，国家级自然保护区向海湿地严重萎缩！为挽救白洋淀和向海湿地的生命，水利部决定，实施引察济向—为向海湿地实施紧急补水，实施引岳济淀—向白洋淀应急调水，这也是我国继黄河、黑河、塔里木河调水，扎龙湿地、南四潮应急补水后再次为恢复生态进行的生态补水工程，是水利部贯彻科学发展观、坚持人与自然和谐相处、走可持续发展水利之路的有一次重要实践。